napari 是一个快速、可交互、可扩展的 Python 图像查看器,专为科学图像分析设计。基于 GPU 加速,支持多维图像浏览、手动标注、丰富的插件生态。
pip install napari[all]
Python 3.9 - 3.12,推荐 conda 虚拟环境
pip install napari[all] -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple
下载速度大幅提升,推荐国内用户使用
基于 VisPy 的 GPU 加速渲染,支持 5D+ 多维图像实时浏览,流畅操作大尺寸数据。
插件生态丰富,支持图像分割、深度学习推理、手动标注、粒子和轨迹追踪等扩展。
与 NumPy、scikit-image、PyTorch、TensorFlow 等科学计算生态无缝集成。
内置 labels 层,支持 2D/3D 手动标注,配合插值功能提升标注效率。
多通道叠加、colormap 自定义、对比度调节、3D 表面渲染,满足各种可视化需求。
通过插件支持 TIFF、Zarr、HDF5、CZI、ND2 等数十种科学图像格式。
集成 scikit-image 的图像处理算子(阈值、分割、滤波)。
三视图正交切片浏览,方便 3D 数据查看和标注。
3D 交互标注工具,支持在三维空间中绘制和编辑。
集成 Cellpose 细胞分割模型,一键分割。
import napari
viewer = napari.Viewer()
viewer.add_image(image_data)