🔬 napari

napari 是一个快速、可交互、可扩展的 Python 图像查看器,专为科学图像分析设计。基于 GPU 加速,支持多维图像浏览、手动标注、丰富的插件生态。

安装

📦 标准安装

pip install napari[all] Python 3.9 - 3.12,推荐 conda 虚拟环境

🚀 国内镜像加速(清华源)

pip install napari[all] -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 下载速度大幅提升,推荐国内用户使用

为什么选择 napari?

⚡ 快速

基于 VisPy 的 GPU 加速渲染,支持 5D+ 多维图像实时浏览,流畅操作大尺寸数据。

🧩 可扩展

插件生态丰富,支持图像分割、深度学习推理、手动标注、粒子和轨迹追踪等扩展。

🐍 Python 原生

与 NumPy、scikit-image、PyTorch、TensorFlow 等科学计算生态无缝集成。

🏷️ 标注工具

内置 labels 层,支持 2D/3D 手动标注,配合插值功能提升标注效率。

🎨 灵活显示

多通道叠加、colormap 自定义、对比度调节、3D 表面渲染,满足各种可视化需求。

📂 格式广泛

通过插件支持 TIFF、Zarr、HDF5、CZI、ND2 等数十种科学图像格式。

常用插件

🔬 napari-skimage

集成 scikit-image 的图像处理算子(阈值、分割、滤波)。

🧠 napari-3d-ortho-view

三视图正交切片浏览,方便 3D 数据查看和标注。

📐 napari-threedee

3D 交互标注工具,支持在三维空间中绘制和编辑。

📡 napari-cellpose

集成 Cellpose 细胞分割模型,一键分割。

👉 浏览所有插件 →

学习资源

📖 官方教程

napari.org 提供完整的入门指南、API 文档和示例代码。

前往学习 →

🎥 视频演示

YouTube 上的 napari 频道包含社区分享的讲座和教程。

观看视频 →

快速上手

第一行代码

import napari
viewer = napari.Viewer()
viewer.add_image(image_data)